Tuscarora Nation School och St. Regis Mohawk School ber var och en om 20 miljoner dollar för att renovera sina byggnader.
Skolorna ägs av staten New York, men drivs av närliggande distrikt och sammanlagt 650 indianstudenter går på dem.
Staten är ansvarig för underhållet av skolorna, men skoltjänstemän säger att staten inte gör tillräckligt.
I en skola föll rör ut ur källartaket vilket orsakade problem och ersattes av staten. Överintendenten kände sig frustrerad över att det krävdes en dålig sak för att den skulle få den uppmärksamhet den behövde, istället för att betala för att fixa det och förhindra det.
Ovanpå det upplever skolor läckande fönster, enstaka översvämmade klassrum och har ett hundra år gammalt tak.
Brandlarm, el- och VVS-system brister.
Medan staten är skyldig att betala för byggnaderna och deras underhåll, säger föreståndare att de har behövt spendera pengar från sina driftsbudgetar.
Driftbudgetar är avsedda att täcka förnödenheter och lärarlöner.
Superintendenterna uppmanar guvernör Kathy Hochul att göra bättre ifrån sig och hjälpa mer än guvernör Cuomo gjorde.
Få de senaste rubrikerna levererade till din inkorg varje morgon? Registrera dig för vår Morning Edition för att börja dagen.
